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课程编号:b049 开课教研室: 医学数学与生物医学工程学教研室
总学时数: 30 学 分: 1.5
主讲教师: 李霞 郭政 开课学期: 第3学期
教材名称: 计算分子生物学与基因组信息学
出 版 社: 黑龙江科学技术出版社
出版时间: 1998年 主编: 郭政 李霞 李晶
课程简介: 基因组计划产生大量作图与测序数据,这促进了计算分子生物学的诞生,而基因组信息学正是其中最具活力的领域。它涉及基因组信息学的获取、存储、分析和解释等各方面,包括发展和有效地利用基因组相关的软件工具和数据库以便处理物理图、遗传图、表达图和序列等信息,并将这些数据资料进行比较分析以解释基因组的信息,例如预测功能基因、调控区及对序列进行同源性分析以揭示生物大分子的结构、功能和进化关系。
教学目的: 通过本课程的学习,使学生熟悉网上的各种基因组信息资源,掌握基因组信息分析的基本原理和方法,具备处理物理图、遗传图、序列等基因组信息的基本能力。
教学重点及要求掌握的内容:
1.序列比较与功能信号检测;
2.基因组序列的统计与信息学分析;
3.人类基因组制图与测序;
4.复杂性状连锁分析与定位克隆策略;
5.分子生物学数据库和分析软件
实践内容及项目:
根据使用偏倚原理改造优化转基因序列;
运用blast原理进行芯片探针设计;
应用分子进化原理进行种群进化年龄的估计。
参考书目:
1.郭政、李霞、饶绍奇.《医学信息分析方法》. 哈尔滨出版社
2.r.durbin et al..《生物序列分析》.清华大学出版社,
3.钟扬、张亮、赵琼.《简明生物信息学》.高等教育出版社 |
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